Prototype 2 tiene un modo Nuevo Juego + que te ofrece la oportunidad de revivir la aventura del juego de otro modo. Para acceder a este modo debes completar el juego al menos una vez.
En Nuevo Juego + tienes extras: Para empezar empiezas con todos los poderes que hayas desbloqueado. También puedes jugar usando el skin de Alex Mercer en lugar de James Heller.
